Speciální pozornost věnujeme mladé generaci. V rámci Ekotopfilm Junior festivalu se zaměřujeme na žáky základních a středních škol. Jedná se o přesně plánovaný a koordinovaný projekt praktického vzdělávání s roční návštěvností až 60 000 dětí z celé České republiky. Program je rozdělen podle témat a věku do bloků a je zpestřen soutěžemi, hrami, kreativními aktivitami a tvůrčími workshopy. Speciální Junior porota dokonce uděluje festivalovou cenu filmům, které ji nejvíc oslovily. Junior festival nabízí také zajímavou příležitost pro aktivní účast festivalových partnerů.